RoseTTAFold:三轨网络的蛋白质结构与相互作用预测新
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RoseTTAFold 由华盛顿大学 David Baker 实验室于 2021 年提出,并发表于 Science。其核心创新是三轨网络:在 1D 序列信息、2D 距离/接触图、3D 坐标表示三条轨道上同时推理,从而兼顾精度与速度,在 CASP14 竞赛中与 AlphaFold2 同期取得突破性表现。
官方实现位于 RosettaCommons/RoseTTAFold。许可需分层看待:代码以 MIT 开源;但训练好的网络权重与配套数据仅限非商业使用,遵循 Rosetta-DL 软件许可(详见 UW IPD 发布页)。这意味着若要做商业应用,需与华盛顿大学另行签署协议——比单纯的宽松代码许可更严格,收录时须明确提示。
对物理 AI 的意义:RoseTTAFold 与 AlphaFold2 同属 CASP14 的里程碑,证明了多轨几何表征可以达到接近实验的精度,并为后续的复合物与相互作用快速建模铺平了道路。
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